அகத்தியர் எழுதிய நூல்களில் கிடைத்தவை:
- அகத்தியர் வெண்பா
- அகத்தியர் வைத்தியக் கொம்மி
- அகத்தியர் வைத்திய ரத்னாகரம்
- அகத்தியர் வைத்தியக் கண்ணாடி
- அகத்தியர் வைத்தியம் 1500
- அகத்தியர் வைத்திய சிந்தாமணி
- அகத்தியர் கர்ப்பசூத்திரம்
- அகத்தியர் ஆயுள் வேத பாஷ்யம்
- அகத்தியர் வைத்தியம் 4600
- அகத்தியர் செந்தூரம் 300
- அகத்தியர் மணி 4000
- அகத்தியர் வைத்திய நூல் பெருந்திரட்டு
- அகத்தியர் பஸ்மம் 200
- அகத்தியர் நாடி சாஸ்திரம்
- அகத்தியர் பக்ஷணி
- அகத்தியர் கரிசில் பஸ்யம் 200
- சிவசாலம்
- சக்தி சாலம்
- சண்முக சாலம்
- ஆறெழுத்தந்தாதி
- காம வியாபகம்
- விதி நூண் மூவகை காண்டம்
- அகத்தியர் பூசாவிதி
- அகத்தியர் சூத்திரம் 30
போன்ற நூல்களை இவர் எழுதியதாகக் கூறப்படுகிறது. மேலும்
- அகத்திய ஞானம் என்னும் அகத்தியம் என்னும் ஐந்திலக்கணம்
- அகத்திய சம்ஹிதை என்னும் வடமொழி வைத்திய நூலும் இவரால் செய்யப்பட்டதாகக் கூறப்படுகிறது.